برسی توانایی ناحیه ژنی SIX۷ در شناسایی فرم مخصوص های Fusarium oxysporum

اعضای Fusarium oxysporum کمپلکسی از گونه های خاکزی به شمار می روند که در خاک های زراعت شده و بایر در آب و هوای مختلف قابل ردیابی هستند. استرین هایی از این گونه بصورت انتخابی روی یک یا گروه کوچکی از میزبان های گیاهی بیماریزا هستند. استرین هایی با گروه میزبانی مشترک در گروه بندی هایی به نام forma specialis یا همان فرم مخصوص قرار می گیرند. تا کنون در شناسایی این فرم مخصوص ها از روش ها و نواحی ژنتیکی زیادی بهره برده شده است اما در بیشتر موارد برای بررسی های یک یا چند فرم مخصوص محدود، قابل استفاده و دارای کارایی بالا بوده اند. از آنجا که در بررسی های روز دنیا استفاده از نواحی ژنومی مسئول بیان پروتئین های دخیل در بیماریزایی بشدت در حال توسعه است در این تحقیق سعی شد تا از ناحیه ی مربوط به تولید پروتئین ترشح شده در آوند چوبی یا به اختصار SIX و به صورت اختصاص یافته ای از SIX۷ استفاده شود. با ارزیابی مولکولی توالی های محدود به ناحیه SIX۷ در ۱۱ فرم مخصوص جمع آوری شده از NCBI مشخص شد که این ناحیه می تواند در شناسایی دقیق فرم مخصوص های بیمارگر این گونه خسارتزا بطور چشمگیر و با تقکیک خوبی به ما کمک کند. این بررسی نشان داد که در بررسی های مولکولی ما می توانیم با نگاه ویژه تری بین نواحی ژنومی و قابل بیان ژنی برای شناخت بهنر گونه ها و ایزوله ها ارتباط برقرار کرده و دست به بررسی های بیشتری بزنیم .

کلیدواژه ها:

Fusarium oxysporum ، فرم مخصوص ، SIX۷ ، ITS ، فیلوژنتیکی