ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

تعیین ژن های خانه دار مناسب برای مطالعه تغییر بیان ژن ها به روش Real- Time PCR در گیاه حرا (Avicennia marina) تحت تیمار نفتی

محل انتشار: فصلنامه علوم و فنون دریایی، دوره: 17، شماره: 4
سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 217

فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1586962

شناسه ملی سند علمی:

JR_JMST-17-4_006

تاریخ نمایه سازی: 25 دی 1401

چکیده مقاله:

مطالعه بیان ژن ها می تواند اطلاعات مهمی از سازوکار ها و راهبردهای فیزیولوژیکی که توسط گیاهان در شرایط تنشی رخ می دهد را روشن نماید. انتخاب ژن های کنترل داخلی مناسب برای تعیین سطوح بیان ژن ها بسیار مهم و ضروری است. تاکنون برای گیاه مانگرو Avicennia marina مطالعه ای در ارتباط با معرفی ژن های مرجع مناسب برای نرمال سازی داده های RT-qPCR گزارش نشده است. در این مطالعه پایداری بیان چهار ژن مرجع اکتین ۲ (ACT۲)، زیرواحد A۳ سرین/ترئونین فسفاتاز ۲A(PP۲AA۳)، TIP-Like، پلی یوبی کوئیتین ۱۰ (UBQ)، در برگ و ریشه گیاه حرا در غلظت های مختف نفت مورد بررسی قرار گرفت. سه نرم افزار (Best Keeper، NormFinder و gNorm) برای آنالیز رتبه بندی ژن ها مورد استفاده قرار گرفت. نتایج نشان داد که ژن ACT یک ژن مرجع مناسب برای گیاه حرا تحت تیمار نفتی است اما استفاده از دو یا سه ژن برای دست یافتن به دقت بالاتر پیشنهاد شد. شناسایی ژن های مرجع در نمونه های بیشتر و تحت شرایط تنشی متنوع تر در آزمایش های آتی به ویژه در تنش های مشابه پیشنهاد شده است.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

بابک مرادی

گروه علوم گیاهی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

حسن زارع مایوان

گروه علوم گیاهی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

منا صراحی نوبر

گروه علوم گیاهی، دانشکده زیست شناسی، پردیس علوم، دانشگاه تهران، تهران، ایران

مهری سیدهشترودی

گروه علوم زیستی دریا، پژوهشکده علوم دریایی، پژوهشگاه ملی اقیانوس شناسی و علوم جوی، تهران، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Czechowski, T., Stitt, M., Altmann, T., Udvardi, M.K. and Scheible, ...
  • Die, J.V., Román, B., Nadal, S. and González-Verdejo, C.I. ۲۰۱۰. ...
  • Ebrahimi-Sirizi, Z. and Riyahi-Bakhtiyari, A. ۲۰۱۳. Petroleum pollution in mangrove ...
  • Heid, C.A., Stevens, J., Livak, K.J. and Williams, P.M. ۱۹۹۶. ...
  • Higuchi, R., Fockler, C., Dollinger, G. and Watson, R. ۱۹۹۳. ...
  • Hong, S.M., Bahn, S.C., Lyu, A., Jung, H.S. and Ahn, ...
  • Hu, R., Fan, C., Li, H., Zhang, Q. and Fu, ...
  • Kong, Q., Yuan, J., Gao, L., Zhao, S., Jiang, W., ...
  • Kong, Q., Yuan, J., Niu, P., Xie, J., Jiang, W., ...
  • Kozera, B. and Rapacz, M. ۲۰۱۳. Reference genes in real-time ...
  • Kulcheski, F.R., Marcelino-Guimaraes, F.C., Nepomuceno, A.L., Abdelnoor, R.V. and Margis, ...
  • Li, X.-S., Yang, H.-L., Zhang, D.-Y., Zhang, Y.-M. and Wood, ...
  • Lilly, S., Drummond, R., Pearson, M. and MacDiarmid, R. ۲۰۱۱. ...
  • Løvdal, T. and Lillo, C. ۲۰۰۹. Reference gene selection for ...
  • Peng, Y.-L., Wang, Y.-S. and Gu, J.-D. ۲۰۱۵. Identification of ...
  • Ramakers, C., Ruijter, J.M., Deprez, R.H.L. and Moorman, A.F. ۲۰۰۳. ...
  • Rashvand, S. and Sadeghi, S.M. ۲۰۱۴. Distribution, Characteristics and Economic ...
  • Remans, T., Smeets, K., Opdenakker, K., Mathijsen, D., Vangronsveld, J. ...
  • Ruijter, J., Ramakers, C., Hoogaars, W., Karlen, Y., Bakker, O., ...
  • Schena, M., Shalon, D., Davis, R.W. and Brown, P.O. ۱۹۹۵. ...
  • Shivhare, R., Lata, C. ۲۰۱۶. Selection of suitable reference genes ...
  • Thellin, O., Zorzi, W., Lakaye, B., De Borman, B., Coumans, ...
  • Tian, C., Jiang, Q., Wang, F., Wang, G.-L., Xu, Z.-S. ...
  • van Bochove, J., Sullivan, E. and Nakamura, T. ۲۰۱۴. The ...
  • Wang, H., Wang, J., Jiang, J., Chen, S., Guan, Z., ...
  • Wang, X., Liu, Y. and Yang, P. ۲۰۱۲. Proteomic studies ...
  • Yang, Y., Hou, S., Cui, G., Chen, S., Wei, J. ...
    • نمایش کامل مراجع